心肌炎和心肌病
    心肌活检可见心肌细胞损伤伴淋巴细胞浸润，且无心肌缺血，是诊断心肌炎的重要标准之一。该标准特异性强，但敏感度低。新近研究提示磁共振技术在心肌炎诊断领域有重要价值。心肌炎患者心肌首过灌注正常伴延迟增强可与心肌梗死鉴别。CMR指导下心肌活检可大大提高心肌炎诊断敏感度。CMR对于鉴别心肌炎病毒类型和判断预后也有一定作用。
    CMR的高分辨力特性可以确定心室腔的大小和结构，动态观察心室形状和容积、室壁运动和心室收缩功能、组织构成及灌注情况，有助于多种心肌病的诊断，对治疗效果及预后判断均有重要价值（图3）。CMR在Tako-tsubo心肌病和缺血性心脏病鉴别方面也有其优势。Tako-tsubo心肌病患者磁共振检查可见心尖区水肿伴收缩功能减低，水肿区无血管，并且无首过灌注缺损和延迟增强等表现。心肌梗死患者磁共振除表现为首过灌注缺损和延迟增强，还有左心室透壁性水肿，水肿区有血管分布。
磁共振技术能够任意方位、多层面成像，全面显示心血管解剖结构、空间位置及连接关系。不仅能够克服超声诊断的操作者依赖性，还能够对心血管造影无法克服的心内结构重叠等细节进行补充。利用“黑血”及“亮血”技术无需对比剂即可显示心腔及大血管形态和血流动力学变化。根据心脏位置、内脏-心房位置关系、心房-心室连接及心室大血管连接进行分析，有助于复杂畸形诊断。肺静脉异位引流患者肺静脉位于左心房后方，表面覆盖肺组织和支气管结构，超声心动图难以准确评价，而心导管检查对紫绀型先天性心脏病患者有较大风险。CMR可清晰显示肺静脉连接关系，对完全型肺静脉异位引流诊断准确率高达100%。CMR用于婴幼儿及胎儿心脏检查，可大大提高先天性心脏病诊断率。由于CMR没有电离辐射，《心血管磁共振专家共识》委员会认为，对于小儿先心病患者只要有断层影像检查的指征，且有专业人员进行操作分析时，可优先使用CMR检查。

心脏瓣膜病
    CMR可显示瓣膜形状、厚度、有无赘生物等。通过cine MRI能够显示瓣膜运动情况和开放、关闭程度。瓣膜狭窄时可见心脏收缩期由于血流快速通过瓣膜形成的信号丢失；瓣膜关闭不全时可见心脏舒张期血液反流造成的信号丢失。相位对比磁共振可通过测量血流速度及返流程度，计算跨瓣压差。CMR还能显示继发于瓣膜病的心脏结构改变。
主动脉、肺动脉疾病
    主动脉疾病主要包括主动脉夹层、壁间血肿、主动脉瘤和先天性主动脉及其分支畸形等。CMR除可显示病变部位、性质、结构和累及范围等，还可通过相位对比磁共振进行血流监测，正确及时治疗提供形态学和功能信息。磁共振技术对肺动脉栓塞及肺动脉高压诊断有很高价值。肺动脉栓塞血栓栓子在T1WI为等信号，T2WI为高信号。肺动脉MRA可显示肺动脉树，栓子表现为血管内充盈缺损。磁共振肺灌注成像显示栓塞血管供血区肺组织楔形灌注缺损，时间-信号强度曲线低平，峰值消失。肺动脉高压CMR表现为右心室增大、主肺动脉干、左右肺动脉管腔扩大。肺动脉MRA可见中心肺动脉扩张，远端分支减少、纤细。磁共振肺灌注成像见两肺灌注延迟、灌注峰值减低、达峰时间后移和峰值时间延长等。
其他方面的应用
    MRI还可用于心肌干细胞移植在体示踪，利用磁性对比剂标记干细胞，对其精确定位，观察移植细胞的迁徙、分化。目前常用对比剂包括产生T1正性对比效应的钆（Gd3+）对比剂和产生较强T2负性对比效应的氧化铁对比剂。氧化铁对比剂能被干细胞吞噬，可用于追踪探测移植的微量干细胞。磁共振荧光透视还能够引导干细胞精确移植，集治疗与监测于一体。
CMR还可用于心脏肿瘤疾病的诊断。CMR可精确显示肿瘤与心血管结构之间的关系，清晰描绘心脏内肿物的位置、大小和范围，通过分析T1、T2不同信号强度，对病变性质作出判断并可观察其向外浸润的情况。CMR心血池信号流空有助于识别心内肿瘤。